层流手术室是采用空气洁净技术对微生物污染源采取程度不同的控制，以达到被控制空间环境内空气洁净度适于各类手术之要求;并提供适宜的温度、湿度，创造一个清新、洁净、舒适、细菌数低的手术空间环境，使患者在手术时组织受到尽可能少的损伤，并大大降低患者和医护人员的二次感染率，尤其是颅内手术和烧伤手术，保证患者术后能更快更好地恢复等。

较之于传统非洁净手术室，层流手术室与其具有几点不同：

控制概念：层流手术室的控制为“全过程控制”，不单是“患者不感染”的结果;传统非洁净手术室依赖药物控制，达到“患者不感染”的结果。

控制要求：层流手术室整个手术过程中要切断所有污染途径(包括空气)，阻止细菌接触切口;传统非洁净手术室依靠药物消毒环境，患者服用大量的抗生素。

控制思路：层流手术室采用的思路是“预防”措施;后者的思路是“补救”措施。

效果：手术室能够“控制全过程”，防止细菌进入人体，药物是补助手段，达到患者受损伤小的结果;传统非洁净手术室内细菌已经进入并损伤人体，再靠药物去控制感染，只体现一个“结果”，而“控制过程”已经失败。